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Rosetta是全球领先的开源蛋白质建模软件套件，由斯坦福大学和哈佛大学等机构联合开发。集成了蛋白质结构预测、设计、配体对接及动力学模拟等功能，广泛应用于药物研发、酶工程、疫苗设计等生物医学领域。
核心功能与模块
1. 蛋白质结构预测
同源建模：基于已知结构模板构建目标蛋白三维结构；
从头预测（Ab initio）：仅根据氨基酸序列预测折叠结构（适用于无模板蛋白）；
密度图拟合：将计算模型与冷冻电镜（Cryo-EM）或X射线晶体学数据整合；
2. 蛋白质设计
序列设计：在保持特定结构的前提下优化氨基酸序列；
功能设计：定制具有新催化活性或结合能力的蛋白质；
界面设计：设计蛋白质 - 蛋白质相互作用界面（如抗体-抗原结合）；
3. 分子对接与药物发现
配体对接：预测小分子药物在蛋白活性位点的结合模式；
虚拟筛选：从化合物库中快速筛选潜在抑制剂；
亲和力优化：通过结构改造提高药物与靶点的结合力；
4. 动态模拟
构象采样：模拟蛋白质柔性和动态变化；
结合路径分析：研究配体 - 蛋白结合的动力学过程；
突变效应预测：评估氨基酸突变对蛋白稳定性和功能的影响；
丁老师服务内容：
Rosetta Commons系统搭建、环境配置、程序安装等。
服务费用：
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丁老师自1998年起开始从事软件科学研发工作，先后为多家上市公司集团提供信息化解决方案，拥有27年资深软件实施经验
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